Orthology data

Phylotree

http://gitlab.sb-roscoff.fr/abims/e-infra/gga/tree/master_gitlab_inria_genodock_demo/swarm#orthology-data

/projet/sbr/phaeoexplorer_raw/finalresult/functional_annotation_orthofinder/Gene_Trees

• Script de chargement (planemo run)
• Test avec un arbre newick
• Test sur un sous-ensemble (e.g. choisir ~100-200 fichiers newick les plus petits en taille de fichier, et importer les organismes inclus dans ces fichiers)
• test sur l'archive totale (~20 000 arbres)

GCV

• [-] Essayer de supprimer/transformer la requete necessitant un gene
• [-] Modifier la requete pour select sur le uniquename au lieu du name
• Wiki:
  • https://github.com/legumeinfo/gcv/wiki
  • https://github.com/legumeinfo/gcv/wiki/Services-API-v1