Release 2.0
- Modification du type de données à la racine du fichier input.yml (liste au lieu d'un dict, le
name
est ajouté comme item supplémentaire au dictionnaire de chaque espècesp_dict
) - ajustement de la fonction
parse_input()
pour tenir compte de la modif précédente - ajustement du fichier input citrus exemple
- simplification de la fonction
get_gspecies_string_from_sp_dict()
- ajout de la date au nom du fichier gff
- fix verbosity arg
- fix banner
- suppression des
replace()
surfull_name
etspecies_folder_name
cargenus
,species
,strain
,sex
sont "nettoyés" en amont avec la fonctionclean_string()
Edited by Loraine Gueguen