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Release 2.0

  • Modification du type de données à la racine du fichier input.yml (liste au lieu d'un dict, le name est ajouté comme item supplémentaire au dictionnaire de chaque espèce sp_dict)
  • ajustement de la fonction parse_input() pour tenir compte de la modif précédente
  • ajustement du fichier input citrus exemple
  • simplification de la fonction get_gspecies_string_from_sp_dict()
  • ajout de la date au nom du fichier gff
  • fix verbosity arg
  • fix banner
  • suppression des replace() sur full_name et species_folder_name car genus, species, strain, sex sont "nettoyés" en amont avec la fonction clean_string()
Edited by Loraine Gueguen

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